Кафедра этномузыкологии была основана в 2003 году. Заведующим кафедрой стала доктор искусствоведения Е.М. Смирнова. В 2009 году кафедра была объединена с кафедрой татарской музыки, а в 2022 году по инициативе ректора В. Р. Дулат-Алеева вновь выделена в самостоятельное структурное подразделение. В настоящее время кафедрой руководит кандидат искусствоведения Л.И. Сарварова.
Основным направлением деятельности кафедры этномузыкологии является изучение традиционных музыкальных культур Поволжья и Приуралья. На базе кафедры плодотворно работает Фольклорно-этнографический кабинет. В настоящее время кабинет ведет планомерную работу по сбору, систематизации и расшифровке музыкально-поэтического фольклора Поволжско-Приурального региона, а также татарского фольклора на всей территории Российской Федерации. География экспедиций обширна: Нурлатский, Мамадышский, Балтасинский, Арский, Рыбно-Слободский, Нижнекамский, Альметьевский, Заинский, Лениногорский, Тетюшский, Дрожжановский, Высокогорский и др. районы Республики Татарстан; Астраханская, Ульяновская, Пензенская, Горьковская, Тюменская, Челябинская, Оренбургская области, ряд районов Республики Мордовия и Республики Башкортостан. Ряд экспедиций осуществлен совместно с различными научными организациями: Центром русского фольклора г. Казани (1997), Чувашским государственным институтом гуманитарных наук (2002), Республиканским центром развития традиционной культуры (2014). На сегодняшний день фонограммархив Кабинета содержит записи татарского, мордовского, удмуртского, чувашского, русского, башкирского фольклора, общий объем которых насчитывает около 15000 единиц хранения.
Кафедрой ведется большая научная работа. Проводятся международные и всероссийские конференции, посвященные различным вопросам изучения традиционной музыки народов Поволжья. Выпускаются монографии, публикуются сборники научных статей. Особое место среди научных трудов занимают серии фольклорных сборников – «Памятники татарского народного музыкально-поэтического творчества» и «Музыкально-поэтический фольклор Поволжья и Приуралья».
Кафедра успешно сотрудничает с Институтом языка, литературы и искусств им. Г. Ибрагимова, Бакинской музыкальной академией им. У. Гаджибейли, Московской государственной консерваторией им. П.И. Чайковского, Санкт-Петербургской государственной консерваторией им. Н.А. Римского-Корсакова, Чувашским государственным институтом гуманитарных наук и многими другими научными и методическими организациями.
На кафедре действуют два исполнительских коллектива: лауреат всероссийских и международных конкурсов Фольклорный ансамбль (рук. - кандидат искусствоведения, доцент Л.И. Сарварова), лауреат республиканского конкурса Ансамбль традиционных инструментов «Бәрәкәт» (руководитель – кандидат искусствоведения, доцент Г.М. Макаров).