Для работы на кафедре духовых и ударных инструментов сразу же после открытия консерватории были приглашены опытные музыканты, которые заложили в Казанской консерватории традиции обучения по специальности духовые и ударные оркестровые инструменты: флейтист Л.М. Шлеймович, фаготист Н.Г. Зуевич, трубач А.П. Колпинский, гобоист М.Ф. Баталов, кларнетисты Х.В. Фазлуллин и Д.Г. Калашников, тромбонист А.А. Леонтьев, исполнитель на ударных инструментах Д.Х. Айдаров. Значительный вклад в развитие исполнительства на духовых инструментах и педагогических традиций кафедры внесли валторнист Е.И. Карпухин (долгое время возглавлявший кафедру духовых инструментов), тромбонист Ш.Г. Низамутдинов (также долгое время возглавлявший кафедру духовых инструментов), флейтист А.Е. Геронтьев; выпускники Казанской консерватории - кларнетист А.И. Гильфанов, трубачи А.В. Величко и В.В. Праченко, тромбонист Г.З. Ройтфарб, валторнист Ю.И. Самарский, флейтисты Д.К. Антонов и А.Н. Смирнова, фаготист И.И. Айнатуллов, тубист В.И. Легащев, гобоист Р.С. Салехов гобоисты Ф.Н. Курпеков и А.А. Бессонов. Основателем класса игры на саксофоне является В.Э. Деринг. Класс ударных инструментов успешно развивается под руководством И.Ф. Сабирьянова.
С 1993 по 2008 гг. кафедрой заведовал народный артист Республики Татарстан Ю.И. Самарский (1948-2008). Кафедра вела активную концертную и организационно-методическую деятельность. Были проведены Открытый региональный конкурс молодых исполнителей на духовых и ударных инструментах (1998), Республиканский фестиваль музыки для духовых и ударных инструментов с приглашением известных европейских музыкантов (1999), Республиканский конкурс молодых исполнителей (2001), Международный фестиваль духовой музыки (2001), I и II Всероссийские конкурсы ансамблей духовых инструментов (2004, 2007).
Воспитанниками кафедры являются артисты Государственного симфонического оркестра Республики Татарстан, оркестра Татарского государственного академического театра опера и балета им. М. Джалиля, симфонических оркестров национальных республик Поволжья, военных духовых оркестров.
В 2008 году кафедра духовых инструментов разделена на кафедру медных духовых и ударных инструментов (заведующий - профессор А.В. Величко) и кафедру деревянных духовых инструментов (заведующий - профессор И.И. Айнатуллов).
В 2019 году духовой оркестр под управлением старшего преподавателя Е.С. Афанасьева стал обладателем Гран-при Всероссийского фестиваля-конкурсе «Виват студент» в Российской академии музыки имени Гнесиных.
Студенты кафедры деревянных духовых инструментов являются лауреатами международных и всероссийский конкурсов, таких как Международный конкурс молодых исполнителей имени Рудольфа Гуммерта, Международный конкурс исполнителей на духовых инструментах имени Н.А. Римского-Корсакова, Международный конкурс Московской консерватории для исполнителей на духовых и ударных инструментах, Молодежных Дельфийских игр и др.
В настоящее время кафедра деревянных духовых инструментов принимает активное участие в творческих проектах консерватории, среди которых можно выделить Всероссийский фестиваль «Дни саксофона в Казанской консерватории» (2022), ежегодный Всероссийский конкурс исполнителей на духовых и ударных инструментах "Духовая академия", проект «Большая музыка – в малые города», в рамках которого проходят концерты и мастер-классы в музыкальных школах и музыкальных училищах, в таких городах как Елабуга, Ижевск, Мамадыш, Набережные Челны, Воткинск, Чайковский и т.д.
Ежегодно проводятся концерты классов преподавателей кафедры, также ведется учебно-методическая деятельность, в рамках которой можно назвать следующие опубликованные работы: Айнатуллов И.И. «Концерт А. Луппова для фагота с оркестром», Бессонов А.А. «Исполнительский анализ Концерта-рапсодии 2 для гобоя с оркестром А. Луппова», Синекопов И.В. «Постановка техники двойного амбушюра при игре на кларнете», Смирнова А.Н. «Геронтьев А. Е. – Заслуженный деятель искусств Чувашской АССР, музыкант», исполнитель, педагог, Шумарина М.А. «Специфические приемы игры в современном сольном репертуаре саксофона».